Por qué las pruebas más rápidas de enfermedades transmitidas por los alimentos podrían obstaculizar el seguimiento de las epidemias

El CDC publicó un informe sobre las tasas de enfermedades transmitidas por los alimentos entre 2012-2015.

Aunque la tasa general de casos de intoxicación alimentaria no ha variado mucho de un año a otro, el informe señala una tendencia creciente en las pruebas de diagnóstico que podría afectar la capacidad de la agencia para identificar y rastrear brotes transmitidos por los alimentos.

El creciente problema proviene del aumento de las pruebas de diagnóstico independientes de cultivos (CIDT).

Informe de los CDC analiza CIDT: Datos básicos

  • Las enfermedades transmitidas por los alimentos son diagnosticado aislando y cultivando (creciendo) muestras de bacterias para confirmar la presencia de algo como salmonela
  • Cultivar es preciso pero requiere mucho tiempo y debe repetirse para cada posible bacteria
  • CIDT es una forma de prueba que puede verificar muestras para múltiples tipos de bacterias y obtener resultados en cuestión de horas, sin la necesidad de cultivos
  • Esta velocidad permite diagnosticar enfermedades transmitidas por los alimentos que de otro modo podrían haberse pasado por alto
  • Aunque t permite que los individuos sean diagnosticados más rápido, no todos los hallazgos CIDT se confirman con cultivo
  • Esto es un problema porque CIDT no puede distinguir entre diferentes cepas o subtipos de bacterias y no produce aislamientos genéticos

En otras palabras, CIDT permite para diagnósticos individuales más rápidos, pero hace que sea más difícil reconocer y rastrear los brotes. Esto se debe a que PulseNet, el sistema que usan los CDC para monitorear e identificar brotes de enfermedades transmitidas por alimentos, se basa en la huella digital de ADN de una cepa bacteriana y otros detalles.

El informe de CDC señala que en 2015, el sistema de seguimiento FoodNet % de la población de EE. UU.) informaron 20,107 infecciones confirmadas por cultivo, pero también vieron 3,112 CIDT que no obtuvieron confirmación de cultivo, aproximadamente el doble del número de 2012.

Lo que podría significar el aumento de CIDT

CIDT es innegablemente eficaz y cumple con una importante necesidad de diagnóstico. Sin embargo, los hallazgos de CIDT no son compatibles con PusleNet y los resultados positivos no se están cultivando en todos los casos. Esto podría conducir a una situación en la que se está produciendo un brote transmitido por los alimentos, pero el CDC no puede reconocerlo o rastrearlo de manera efectiva ya que los datos necesarios simplemente no están disponibles. Para ser claros, no hay indicaciones actuales de que las cosas hayan llegado a este punto, pero es una posibilidad real que el CDC tenga en cuenta.

¿Qué se está haciendo al respecto?

Actualmente se están realizando esfuerzos para explorar diferentes métodos PulseNet podría funcionar sin la necesidad de aislamientos bacterianos de cultivos. Algunos ejemplos incluyen secuenciación de próxima generación, una forma de secuenciación rápida del genoma y metagenómica, una forma de identificar el código genético de la muestra de un paciente.

Mientras tanto, el CDC está trabajando con otros funcionarios y laboratorios de salud pública para promover las pruebas y cultivo de cualquier hallazgo CDIT positivo. También se están investigando formas de facilitar el almacenamiento y el proceso de cultivo.

Todas estas medidas se encuentran todavía en una etapa inicial, pero representan la evolución continua de la seguridad alimentaria y el seguimiento de brotes. PulseNet tiene actualmente 20 años y el CDC tiene la plena intención de ver que el sistema siga siendo ágil y efectivo en el futuro.


Fuentes:
Huang, J., et. al., "Infección con patógenos transmitidos comúnmente a través de los alimentos y el efecto del uso cada vez mayor de pruebas de diagnóstico independientes culturales en la vigilancia – Red de vigilancia activa de enfermedades transmitidas por los alimentos, 10 sitios de EE. UU., 2012-2015", Informe semanal de morbilidad y mortalidad 2016; http://www.cdc.gov/mmwr/volumes/65/wr/mm6514a2.htm?s_cid=mm6514a2_x .
"El futuro de PulseNet", sitio web de los CDC, actualizado por última vez el 16 de febrero , 2016; http://www.cdc.gov/pulsenet/next-generation.html visitado por última vez el 15 de abril de 2016.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *